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法媒:计算机算力或成抗疫关键 制作新冠病毒3D模型

原标题:法国媒体:计算机计算能力还是新皇冠病毒3D模型防疫制作的关键 法国媒体4月27日报道称,计算机和超级计算机将有一项光荣的任务:制作新冠状病毒蛋白质的3D…

原标题:法国媒体:计算机计算能力还是新皇冠病毒3D模型防疫制作的关键

法国媒体4月27日报道称,计算机和超级计算机将有一项光荣的任务:制作新冠状病毒蛋白质的3D模型。起初只有30,000台电脑,但现在已经有700,000多台电脑加入了“折叠家庭”项目。项目负责人、美国生物化学家格雷格·鲍曼(Greg Bowman)高兴地说:“有了这种参与的势头,并吸引了许多个人和组织,我们实际上创造了世界上最强大的计算机。”

根据法国周刊《快报》网站4月25日的报道,真实情况肯定会略有不同。从科学的角度来看,通过无线网络交替进行数百万次小计算远不如超级计算机专注于一项任务有效。此外,Folding@Home项目宣布的每秒240亿次浮点运算可能从未被完全部署和使用。然而,该项目仍然使人们在理解一件事上取得进展——蛋白质建模,尤其是新的冠状病毒蛋白质模型。

巴黎索邦大学教授让-菲利普·皮马尔德说:“这一领域的研究正处于爆发期。世界上有几十个实验室在运行。他们将病毒分成许多部分,并试图用模型以虚拟的形式表达出来。”

这是什么目的?是为了促进新皇冠肺炎的治疗。因为,为了使药物有效,研究人员必须知道药物在哪里起作用。3D模型可以描述药物作用的机制,然后模拟其与目标(例如某种病毒)的相互作用。之后,进行体外和体内试验。

皮马尔德解释说:“到目前为止,医生已经根据他们自己的认知进行了一些实验。我们基于物理、信息技术或化学做不同的研究。这种研究可以让人们对病毒有更多的了解,其结果将与其他实验室分享。在新冠状病毒的问题上,尽管时间在流逝,但仍然存在无法找到有效抑制手段的风险。这种情况在过去的艾滋病研究中已经出现过。目前,没有针对艾滋病的疫苗,人们不得不依靠计算机来研究预防性治疗。”

如果正在进行的测试的最终结果令人失望,计算机可能会带来新的治疗概念。皮马尔德进一步解释说:“一旦我们有了一个好的模型,我们就可以进行虚拟筛选,也就是说,找到那些能与病毒相互作用的药物成分。”然而,由于存在成千上万种可能性,模拟过程可能需要很长时间,而准确的结果也需要大量的计算和时间。

此外,计算不是成功的保证。无数的物理定律也应该被考虑。皮马尔德说:“在微观层面,我们将看到水、离子和高能电子区域的相互作用…我们对物理学的理解仍有许多偏差。”

主编:范·斯汀

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