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中国人基因库研究结果发表:日本人与北方汉族人重叠

中国基因库最大规模研究的结果首次发表。汉族可分为7个亚组 中国基因库最大规模研究成果首次发表。 4月30日,由瑞金医院内分泌科牵头的中国地图联盟与全国29家研究…

中国基因库最大规模研究的结果首次发表。汉族可分为7个亚组

中国基因库最大规模研究成果首次发表。

4月30日,由瑞金医院内分泌科牵头的中国地图联盟与全国29家研究机构和医院在中国科学院上海生命科学研究所主办的《细胞研究》杂志上首次报道了对27个直辖市、8个民族、1万多人的高深度基因组测序数据和表型的系统分析。

研究团队在40×深的深度上对中国不同地区和民族的10588个样本进行了测序,完成了中国人群高质量遗传变异数据的构建、中国人群结构分析、基因组特征比较、变异谱分析和致病性变异分析。

这份出版物意味着,通过中国人自己的工具、平台和分析方法,对中国人的基因组特征进行深入和广泛的研究,具有前所未有的意义。

日本人口和中国北方汉族人口的聚集完全重叠

为什么有些人喝酒时会脸红,为什么有些人更容易患癌症?事实上,这些都与体内的某些特定基因有关。

长期以来,许多关于中国遗传病的研究都直接应用了外国人的数据和结论。然而,由于不同地区的人群和种族在历史起源和遗传背景上的巨大差异,直接将其他人群的有偏见的知识和结论作为中国人疾病风险评估、遗传咨询或诊断治疗的基础是不完善和不可靠的。

国家代谢性疾病临床医学研究中心(上海)在瑞金医院领导的多项全国性队列研究的基础上,依托国家转化医学重大科技基础设施(上海)和医学基因组国家重点实验室,实施了中国代谢分析项目。

本文图片均为“上海交通大学医学院附属瑞金医院”的微信公众号
该研究涵盖了中国的7个地理区域,包括前10名的汉族、壮族、回族、满族、苗族、彝族、藏族和蒙古族人口,显示了中华民族在不同地理区域的遗传背景的多样性和复杂性。

该研究小组首次发现,汉族人口可分为七个亚组:北汉、西北汉、东汉、中原汉、南汉、东南汉和岭南汉。

在少数民族中,藏族、彝族、蒙古族、苗族和壮族都有独特的民族群体,而满族在北方与汉族相似,回族在西北和北方与汉族相似。不同地区人口的变化特征也与中国历史上的人口迁移和变迁有关。例如,河西走廊是丝绸之路上不同民族迁徙的主要交通路线。历史上,包括Sogd和其他民族在内的许多民族都曾在这里生活和经商。

瑞金医院内分泌科主任王维卿教授表示,该研究团队对代表中国不同地区和民族的10588份DNA样本进行了40倍深的基因组测序,完成了中国人群高质量遗传变异数据的构建、中国人群结构分析、基因组特征比较、变异谱分析和致病性变异分析。在中国地图数据库的第一阶段,有1.36亿个单核苷酸多态性位点和1000万个插入或缺失位点(NDEL),其中一半是在许多国际使用的数据库中没有发现的新位点。

许多遗传病都写在遗传密码里。中国人和欧美人的疾病相关突变位点的频率不同。因此,中国的基因咨询和解释、重要性不确定的基因突变研究(VUS)以及相关临床指南和途径的制定需要基于中国自身的大样本和高质量数据。

研究表明,现代河西走廊地区的人群具有越来越复杂的遗传多态性位点。与世界上的其他人相比,中国人的遗传特征与欧洲、非洲、南亚和拉丁美洲的人有很大的不同,与非洲的差异最大,与东亚的非常相似。研究人员在成分分析中发现,日本人口和中国北方汉族人口的聚类完全重叠。

山东人的酒量并不突出

中国地图还分析和比较了中国人营养代谢和药物代谢相关的遗传特征。

至于被广泛关注的酒精代谢能力,一般来说北方人比南方人喝得好。西藏人、蒙古人、彝族人和河南人都是这个国家的顶级饮酒者。山东人不怎么喝酒,而福建人和广东人是最后一批。

中国地图证实,乙醛脱氢酶2基因rs671的突变是东亚特有的,在中国人群中携带者(4.50%为纯合子,34.27%为杂合子)远远高于世界其他地区。rs671的变异也是食管癌的重要危险因素,所以喝红脸应该少。

代谢性疾病,特别是2型糖尿病和肥胖症,已成为中国和世界上发病率最高的主要慢性病。然而,欧洲人群中最显著的2型糖尿病遗传风险TCF7L2基因突变(如rs7903146)在中国人群中非常低,这表明仅参考和验证欧美人群在代谢特征和疾病研究中的结果是不够的。

此外,由人携带的某种基因变异引起疾病的风险可能不大,但多种基因变异的组合对个体特征有显著影响。因此,基于特定人群的大规模基因型和表型数据库,通过多基因风险评分(PRS)来评估个体疾病风险是相对准确的方法。

在中国地图研究中,研究人员对具有多基因风险的2型糖尿病的遗传风险进行了评分,该评分按照定量评分、年龄和血糖值的顺序在三维空间中显示了整个人口中每个人的精确位置。多基因风险评分排名显示,2型糖尿病高危和低危个体之间的血糖差异非常显著。随着年龄的增长,高风险个体的空腹和餐后2小时血糖显著高于中风险和低风险个体。

此外,比较证明基于东亚人口的基础数据比基于欧洲人口的数据更准确。这些结果表明基于中国人群基础数据的2型糖尿病和其他代谢性疾病的准确风险评估的重要性,这对于重大慢性病的预防、个体化健康管理和公共卫生决策具有重要价值。

总之,中国地图已经建立了一个高质量的中国人口数据库,基于覆盖中国所有地区的研究队列。通过深入的全基因组数据和精细的表型分析,可以为疾病机制研究、预防、遗传咨询和公共卫生管理提供依据。

责任编辑:郑

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